Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms