Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A3Q96HJ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A3Q96HJ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A3Q96HJ5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A3Q96HJ5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A3Q96HJ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A3Q96HJ5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms