Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms