Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms