Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms