Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM52Q96A61 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms