Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD1Q969G9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms