Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FRAT1Q92837 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms