Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRUQ92729 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms