Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms