Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSH3Q8TE77 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms