Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms