Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms