Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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