Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGDNQ8NEJ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NGDNQ8NEJ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms