Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMCO5AQ8N6Q1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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TMCO5AQ8N6Q1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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TMCO5AQ8N6Q1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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