Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC155Q8N6L0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms