Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCP3Q8IZU3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms