Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM1Q8IZ96 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM1Q8IZ96 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms