Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms