Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms