Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TXNDC2Q86VQ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms