Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG4DQ86TL0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms