Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms