Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOP1Q7RTM1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms