Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYDE1Q6ZW31 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms