Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms