Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC9Q6ZRR7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms