Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4L3Q6VB84 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms