Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A10Q6U841 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms