Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms