Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms