Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
REEP3Q6NUK4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
REEP3Q6NUK4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms