Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSBN1Q5VWQ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms