Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms