Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms