Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CC2D1BQ5T0F9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CC2D1BQ5T0F9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms