Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms