Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms