Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKAP4Q5JQC9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKAP4Q5JQC9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms