Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN4Q5BKX8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms