Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms