Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYTL3Q4VX76 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYTL3Q4VX76 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms