Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPRNQ4KMQ1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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