Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TBRG1Q3YBR2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms