Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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