Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms