Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms