Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC57Q2TAC2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms