Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms